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식물검역 바이러스 검사법

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출판사 서평

우리나라는 1978년 국립식물검역소를 발족한 이후 전자현미경 검경을 거쳐 ELISA를 이용하여바이러스를 검사해왔습니다. 하지만 항체의 특이성이 문제되었을 뿐만 아니라, ELISA의거짓양성반응이 밝혀짐으로써 바이러스 검역 시스템의 변화가 필요하게 되었습니다. 그러는동안 분자생물학이 비약적으로 발전하여 PCR 방법에 대한 많은 연구와 논문이 쏟아져 나왔고,국내 회사들 역시 PCR 재료를 생산하는데 상당히 높은 수준을 갖게 되었습니다.
바이러스 검역에 PCR 검사법을 도입하여 2006-2008년에 검역대상 바이러스 24종의RT&Nested-PCR 검사법을 개발하였고, 2009-2011년에 15종, 2012-2014년에 5종을 추가 개발하였습니다. RT&Nested-PCR 검사를 실시한 후부터 바이러스 검출 건수가 크게증가함으로써 국경 검역을 강화하는데 기여할 수 있었습니다.
그러는 동안 검역대상 바이러스 목록과 검사대상 수입식물 목록이 개정됨에 따라 검사량 역시증가하게 되었습니다. 최근에는 구매 대행업체 등 전자상거래의 발전과 더불어 국내 소비자들의 소비 패턴이 해외직구로 급속하게 전환되고 있는 상황입니다. 이와 함께 바이러스 정밀검사 건수가 크게 증가하게 되었고 좀 더 효율적이고 간편한 검사법을 요구하는 목소리가 높아졌습니다.
이를 해소하고 바이러스 검역 업무를 효율화 하는데 도움이 되기 위해 2011-2012년에 검사건수가 많은 5품목에 대해 multiplex RT&Nested-PCR 검사법을 개발하였고, 2015-2017년에 38종 바이러스에 대해 probe real-time PCR 검사법을 개발하였습니다.
본 책자는 그동안의 연구사업을 통해 개발된 검역대상 바이러스를 검사하기 위한
RT&Nested-PCR, multiplex RT&Nested-PCR 및 probe real-time PCR 검사방법에 대해 설명하였고, PCR 검사를 하는 데에 필요한 프라이머, PCR product 사이즈, 양성대조구 정보를 포함하였을 뿐만 아니라, 염기서열 분석 시 유의사항, 식물검역 바이러스 검사 절차 등에 대해 수록하였습니다. 본 책자가 실험실 정밀 검사자들이 식물검역 바이러스를 검사하는데 많은 도움이 될 수 있기를 바랍니다.

목차

PART 1. 식물검역 바이러스 검사 매뉴얼
I. 검사 절차: 종자&구근, 묘, 묘목 3
II. Probe real-time PCR 검사법을 이용한 실험 및 결과 분석 5
III. RT&Nested-PCR 검사법을 이용한 실험 9
IV. Multiplex RT&Nested-PCR 검사법을 이용한 실험 11
V. PCR 검사법 결과 분석 13

PART 2. Probe real-time PCR 검사법
I. 연구사업 보고서 17
II. 식물검역 바이러스 36종의 probe real-time PCR 검사법 개발 결과
1. APLV Andean potato latent virus 31
2. APMoV Andean potato mottle virus 32
3. ArMV Arabis mosaic virus 33
4. BCMNV Bean common mosaic necrosis virus 34
5. BPMV Bean pod mottle virus 35
6. CGMMV Cucumber green mottle mosaic virus 36
7. CLRV Cherry leaf roll virus 37
8. CNFV Carnation necrotic fleck virus 38
9. CNRMV Cherry necrotic rusty mottle virus 39
10. CPMMV Cowpea mild mottle virus 40
11. CRLV Cherry rasp leaf virus 41
12. CRSV Carnation ringspot virus 42
13. FoMV Foxtail mosaic virus 43
14. GFLV Grapevine fanleaf virus 44
15. INSV Impatiens necrotic spot virus 45
16. IYSV Iris yellow spot virus 46
17. KGMMV Kyuri green mottle mosaic virus 47
18. LRSV Lychnis ringspot virus 48
19. PDV Prune dwarf virus 49
20. PEMV Pea enation mosaic virus 50
21. PepMV Pepino mosaic virus 51
22. PMTV Potato mop-top virus 52
23. PRMV Peach rosette mosaic virus 53
24. PSTVd Potato spindle tuber viroid 54
25. PZSV Pelargonium zonate spot virus 55
26. RpRSV Raspberry ringspot virus 56
27. SBMV Southern bean mosaic virus 57
28. SLRSV Strawberry latent ringspot virus 58
29. SqMV Squash mosaic virus 59
30. TBRV Tomato black ring virus 60
31. TBSV Tomato bushy stunt virus 61
32. ToRSV Tomato ringspot virus 62
33. TRSV Tobacco ringspot virus 63
34. TSV Tobacco streak virus 64
35. TYMV Turnip yellow mosaic virus 65
36. WSMV Wheat streak mosaic virus 66
III. Probe real-time PCR 검사법 troubleshoot 67
IV. 부록
Probe real-time PCR 검사법의 primer, probe 및 염기서열 정보 72

PART 3. RT&Nested-PCR 검사법
I. 연구사업 보고서 87
II. 식물검역 바이러스 37종의 RT&Nested-PCR 검사법 개발 결과
1. APLV Andean potato latent virus 105
2. APMoV Andean potato mottle virus 113
3. ArMV Arabis mosaic virus 124
4. BCMNV Bean common mosaic necrosis virus 131
5. BPMV Bean pod mottle virus 142
6. CCMV Cowpea chlorotic mottle virus 154
7. CGMMV Cucumber green mottle mosaic virus 164
8. CLRV Cherry leaf roll virus 171
9. CNFV Carnation necrotic fleck virus 181
10. CNRMV Cherry necrotic rusty mottle virus 190
11. CPMMV Cowpea mild mottle virus 193
12. CRLV Cherry rasp leaf virus 200
13. CRSV Carnation ringspot virus 206
14. CtRLV Carrot red leaf virus 217
15. FoMV Foxtail mosaic virus 221
16. GFLV Grapevine fanleaf virus 225
17. IYSV Iris yellow spot virus 237
18. KGMMV Kyuri green mottle mosaic virus 247
19. LRSV Lychnis ringspot virus 254
20. PCV Peanut clum virus 261
21. PDV Prune dwarf virus 269
22. PEMV Pea enation mosaic virus 282
23. PepMV Pepino mosaic virus 289
24. PMTV Potato mop-top virus 298
25. PRMV Peach rosette mosaic virus 307
26. PSTVd Potato spindle tuber viroid 317
27. PZSV Pelargonium zonate spot virus 324
28. RpRSV Raspberry ringspot virus 331
29. SBMV Southern bean mosaic virus 345
30. SLRSV Strawberry latent ringspot virus 352
31. SqMV Squash mosaic virus 362
32. TBRV Tomato black ring virus 369
33. TBSV Tomato bushy stunt virus 378
34. ToRSV Tomato ringspot virus 385
35. TRSV Tobacco ringspot virus 397
36. TSV Tobacco streak virus 408
37. WSMV Wheat streak mosaic virus 416
III. 부록
바이러스별 primer, PCR product 사이즈 및 돌연변이 양성대조구의
염기서열 정보

PART 4. Multiplex RT&Nested-PCR 검사법
I. 연구사업 보고서 447
II. 5품목의 multiplex RT&Nested-PCR 검사법 개발 결과
1. 박과 461
2. 페튜니아 468
3. 상추 475
4. 고추&토마토 A 482
5. 토마토 B 490

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